线图（误差线）

作者

[编辑] 郑虎;

[审核] .

注记

Hiplot 网站

本页面为 Hiplot Line (errorbar) 插件的源码版本教程，您也可以使用 Hiplot 网站实现无代码绘图，更多信息请查看以下链接:

https://hiplot.cn/basic/line-errorbar?lang=zh_cn

误差线主要指示数据每一个数据点的误差范围，显示潜在的误差或相对于系列中每一个数据的的不确定程度。

环境配置

  • 系统: Cross-platform (Linux/MacOS/Windows)

  • 编程语言: R

  • 依赖包: ggpubr

# 安装包
if (!requireNamespace("ggpubr", quietly = TRUE)) {
  install.packages("ggpubr")
}

# 加载包
library(ggpubr)

数据准备

载入数据为两种分组及其对应的数值。

# 加载数据
data <- read.delim("files/Hiplot/093-line-errorbar-data.txt", header = T)

# 整理数据格式
data[, 3] <- factor(data[, 3], levels = unique(data[, 3]))

# 查看数据
head(data)
  Value Group2 Group1
1   4.2 treat1    low
2  11.5 treat1    low
3   7.3 treat1    low
4   5.8 treat1    low
5   6.4 treat1    low
6  10.0 treat1    low

可视化

# 线图（误差线）
p <- ggline(
  data, x = "Group1", y = "Value", color = "Group2",
  add = "mean_se", title = "Line plot with errorbar", palette = "npg") +
  stat_compare_means(aes_(group = as.name("Group2"))) +
  theme_bw() +
  theme(text = element_text(family = "Arial"),
        plot.title = element_text(size = 12, hjust = 0.5),
        axis.title = element_text(size = 12),
        axis.text = element_text(size = 10),
        axis.text.x = element_text(angle = 0, hjust = 0.5,vjust = 1),
        legend.position = "right",
        legend.direction = "vertical",
        legend.title = element_text(size = 10),
        legend.text = element_text(size = 10))

p
图 1: 线图（误差线）

low 类型中的红色上线表示 treat1 中 low 类型中数值最大值，红色下线表示 treat1 中 low 类型中数值最小值，其他以此类推。分别对treat1 和 treat2 按照 low，mid，high 类型进行秩和检验，显示 P 值于图形上方。