# 安装包
if (!requireNamespace("data.table", quietly = TRUE)) {
install.packages("data.table")
}
if (!requireNamespace("jsonlite", quietly = TRUE)) {
install.packages("jsonlite")
}
if (!requireNamespace("ggpubr", quietly = TRUE)) {
install.packages("ggpubr")
}
# 加载包
library(data.table)
library(jsonlite)
library(ggpubr)线图(误差线)
注记
Hiplot 网站
本页面为 Hiplot Line (errorbar) 插件的源码版本教程,您也可以使用 Hiplot 网站实现无代码绘图,更多信息请查看以下链接:
误差线主要指示数据每一个数据点的误差范围,显示潜在的误差或相对于系列中每一个数据的的不确定程度。
环境配置
系统: Cross-platform (Linux/MacOS/Windows)
编程语言: R
依赖包:
data.table;jsonlite;ggpubr
sessioninfo::session_info("attached")─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
setting value
version R version 4.5.2 (2025-10-31)
os Ubuntu 24.04.3 LTS
system x86_64, linux-gnu
ui X11
language (EN)
collate C.UTF-8
ctype C.UTF-8
tz UTC
date 2026-01-28
pandoc 3.1.3 @ /usr/bin/ (via rmarkdown)
quarto 1.8.27 @ /usr/local/bin/quarto
─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
package * version date (UTC) lib source
data.table * 1.18.0 2025-12-24 [1] RSPM
ggplot2 * 4.0.1 2025-11-14 [1] RSPM
ggpubr * 0.6.2 2025-10-17 [1] RSPM
jsonlite * 2.0.0 2025-03-27 [1] RSPM
[1] /home/runner/work/_temp/Library
[2] /opt/R/4.5.2/lib/R/site-library
[3] /opt/R/4.5.2/lib/R/library
* ── Packages attached to the search path.
──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
数据准备
载入数据为两种分组及其对应的数值。
# 加载数据
data <- data.table::fread(jsonlite::read_json("https://hiplot.cn/ui/basic/line-errorbar/data.json")$exampleData$textarea[[1]])
data <- as.data.frame(data)
# 整理数据格式
data[, 3] <- factor(data[, 3], levels = unique(data[, 3]))
# 查看数据
head(data) Value Group2 Group1
1 4.2 treat1 low
2 11.5 treat1 low
3 7.3 treat1 low
4 5.8 treat1 low
5 6.4 treat1 low
6 10.0 treat1 low
可视化
# 线图(误差线)
p <- ggline(
data, x = "Group1", y = "Value", color = "Group2",
add = "mean_se", title = "Line plot with errorbar", palette = "npg") +
stat_compare_means(aes_(group = as.name("Group2"))) +
theme_bw() +
theme(text = element_text(family = "Arial"),
plot.title = element_text(size = 12, hjust = 0.5),
axis.title = element_text(size = 12),
axis.text = element_text(size = 10),
axis.text.x = element_text(angle = 0, hjust = 0.5,vjust = 1),
legend.position = "right",
legend.direction = "vertical",
legend.title = element_text(size = 10),
legend.text = element_text(size = 10))
p
low 类型中的红色上线表示 treat1 中 low 类型中数值最大值,红色下线表示 treat1 中 low 类型中数值最小值,其他以此类推。分别对treat1 和 treat2 按照 low,mid,high 类型进行秩和检验,显示 P 值于图形上方。
