生信爱好者周刊(第 171 期):《自然》:150多年后,性爱的感官秘密终于解开¶
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封面图¶
本周话题:《自然》:150多年后,性爱的感官秘密终于解开¶
克劳斯小体(Krause corpuscles)是位于皮肤下紧包球体内的神经末梢,150多年前在人类生殖器中首次被发现。这种结构很像人类手指和双手上的触摸激活小体——这些小体会在皮肤穿过纹理表面时对振动做出反应。
Ginty与合作者利用各种机械和电刺激激活了雄性和雌性小鼠体内的克劳斯小体。这些神经元会对40-80赫兹范围内的低频振动放电。团队还发现,雄性和雌性小鼠的生殖器包含相等数量的小体,这些小体会在小鼠发育过程中随器官生长在空间上分散开来。基因改造后缺少克劳斯小体的小鼠无法正常交配,说明这个结构对于性的必要性。进一步研究这些神经细胞能帮助治疗勃起功能障碍和阴道疼痛这类疾病。
@ShixiangWang
- 人是“有机”的机械装置,有时候对人体的运行图景感觉非常神秘和魔幻。从对世界的探索中,我们开发了多种科技技术来延展我们对世界的感知和反应,但对于机体内的这些秘密却感知和传播的极少。
生信研究¶
1、Cell | 让人人都能建立虚拟细胞实验室!科学家创建“细胞语法”,用人类语言预测细胞行为
文章创建了一套革命性的“细胞语法”,只需使用简单的人类自然语言描述,就能模拟癌细胞转移、免疫细胞作战甚至大脑发育,让没有编程背景的生物学家也能构建虚拟细胞实验室,从而加速癌症、神经科学等领域的突破。
- 论文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00750-0
2、Genome Biology|综合比较评估24种变异效应预测方法
本研究旨在利用未被用于预测方法训练的人群水平基因型和表型队列数据,对现有的计算变异效应预测方法进行无偏评估,并确定哪种预测方法最能有效地推断人类性状。
- 论文链接:https://doi.org/10.1186/s13059-024-03314-7
3、Nature Protocols | 使用clusterProfiler刻画多组学数据研究方案
文章将clusterProfiler应用到包括空间转录组、蛋白质组和表观基因组在内的多种组学数据。
- 论文链接:https://www.nature.com/articles/s41596-024-01020-z
博文资讯¶
推文通过构建测试数据,将分位数回归计算与普通OLS回归进行比较,讲解分位数回归的意义及用法。
git 是当代软件编码记录的核心基础工具,其主要通过构建一个隐藏的.git目录进行控制和管理,本文通过图文汇总形式揭秘。
Bash脚本是Unix和Linux系统管理的基石,它提供了强大的工具来自动化重复的任务、简化工作流和处理复杂的操作。对于那些已经熟悉基本脚本的人来说,深入研究先进的技术可以解锁新的效率和能力水平。这篇文章将探讨Bash中的高级shell脚本技术,重点是脚本优化、健壮的错误处理和自动化复杂的系统管理任务。
工具¶
8、Text to Logo & Favicon | 文本构造图标
9、DrugCLIP | 24小时内完成对1万个人类蛋白与5亿小分子的虚拟筛选任务
清华大学人工智能研究院与生命科学学院联合发布新成果——DrugCLIP,一项结合对比学习与稠密检索(dense retrieval)的AI系统,在24小时内完成对1万余个人类蛋白与5亿小分子的虚拟筛选任务,速度比传统方法快10万倍。更令人兴奋的是,该系统不仅在两个精神疾病靶点(5HT2AR和NET)中筛选出多个高亲和力分子,还首次建立了“基因组级”虚拟筛选数据库,面向全球开放,开启“后AlphaFold”时代的药物发现新范式。
- DOI: 10.1101/2024.09.02.610777
- 网址: https://www.drugclip.com/index
资源¶
10、DNA学习中心 DNA from the Beginning
贡献者(GitHub ID)¶
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(王诗翔)@kkjtmac
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(赵启祥)@He-Kai-fly
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(张佳楠)@Tomcxf
(陈啸枫)@wangdepin
(王德品)@kongjianyang
(空间阳)@donghongyu2020
(董弘禹)@DrRobinLuo
(罗鹏)@Wangcy-rachel
- 王春阳@zoe3251
- 舒晨阳
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(完)