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生信爱好者周刊(第 159 期):巴菲特的选人标准

这里记录每周值得分享的生信相关内容,周日发布。

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「生信周刊讨论区」

封面图

冰岛 - 杰古沙龙冰河湖

本周话题:巴菲特的选人标准

巴菲特说,他考察候选人,就看三个“i”。 即

•integrity(正直)

•intelligence(智慧)

•initiative(主动)

这三个“i”当中,“主动”最重要。“正直”和“智慧”的人到处都是,但如果不主动,不是自己想去做些什么,就什么也不会发生。

生信研究

1.Cell | 多参数成像揭示头颈癌临床相关的癌细胞-间质相互作用动力学

文章通过整合细胞状态和形态标记进行图像分析,探讨了在驱动肿瘤侵袭过程中肿瘤和基质之间的相互作用。

  • 文章链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.09.046

2.艾伦研究所与华盛顿大学团队推出开源科研大模型 OpenScholar,用小参数超越 GPT-4o

越来越多的研究人员开始使用 ChatGPT、Perplexity 等 AI 工具来进行文献检索和信息综合。 然而,这些通用模型在处理科学问题时往往存在生成幻觉、成本高昂以及参数规模过大的缺陷,限制了它们在科学领域的适用性。 为此,由艾伦人工智能研究所 (Ai2) 和华盛顿大学合作,开发了一个针对科研的开源模型 OpenScholar。 作为一种“检索增强型语言模型”(Retrieval-Augmented Language Model),它将尖端检索系统与经过微调的语言模型相结合,旨在应对科学查询时能够检索出相关文献并生成带有真实引用的综合性回答。

3.Nat Commun | 百岁老人罕见 LOF 突变负荷显著降低,揭示健康长寿的潜在遗传机制

文章通过分析大群体德系犹太人的全外显子测序数据,全面比较了罕见 LOF 突变负荷。与对照组相比,百岁老人的 LOF 突变负荷明显较低,其后代中也观察到了类似效应。

  • 文章链接:https://doi.org/10.1038/s41467-024-52967-2

博文资讯

4.GitHub Spark 通过英语创建 app

GitHub Spark 是一个由人工智能驱动的工具,用于创建和共享微应用程序(“sparks”),可以根据您的确切需求和偏好量身定制,并且可以直接从您的桌面和移动设备上使用。无需编写或部署任何代码。

  • 主页链接:https://githubnext.com/projects/github-spark

5.一文速通 WDL

文中介绍了经典生物信息学工具 WDL 的使用教程,包含解释和完整的代码。

6.五世科学不衰、四世革命不断|八代家谱

辛顿家族最辉煌的是两百年前数学家 Boole、其数学家和教育家的妻子 Mary Everest 以及他们的 5 个孩子。辛顿家谱多彩多姿:屠夫、牧师、数学家、律师、作家、革命者、养牛郎/放牛妹、被涂黑诬陷为杀人的。在这样的背景下,2024 年获诺贝尔奖似乎小菜一碟

工具

7.rag-web-ui | 基于 RAG(检索增强生成)技术的智能对话系统

  • 项目地址:https://github.com/rag-web-ui/rag-web-ui

8.Galaxy | 数据分析宇宙

Image

Galaxy 是一个免费的开源系统,用于数据分析、工作流程创作、培训和教育、发布工具、基础设施管理以及更多。

  • 项目地址:https://galaxyproject.org/

9.Liubai | 你的笔记 + 日程 + 待办清单 + 任务 with AI

在企业和开发者社区中,可靠地监控服务状态变得越来越重要。Kener 应运而生,它是一个现代的自托管状态页面,使得服务状态监控和通知变得轻松而直观。

  • 项目地址:https://github.com/yenche123/liubai

资源

10.表观遗传系列视频

本视频为 2016 年复旦大学「表观基因组学暑期国际讲习班」的录制视频,是入门、精进表观基因组学不可多得的珍贵材料。

11.中文 CSL 样式 - Zotero 中文社区

本仓库提供了一系列中文期刊和学位论文的 CSL 样式,其中大部分是由 GB/T 7714—20151 衍生的。

  • 项目链接: https://github.com/zotero-chinese/styles

贡献者(GitHub ID)

「Openbiox 生信周刊」运维小队:

  • @ShixiangWang(王诗翔)
  • @kkjtmac(阚科佳)
  • @NiEntropy(赵启祥)
  • @He-Kai-fly(何凯)
  • @JnanZhang(张佳楠)
  • @Tomcxf(陈啸枫)
  • @wangdepin(王德品)
  • @kongjianyang(空间阳)
  • @donghongyu2020(董弘禹)
  • @DrRobinLuo(罗鹏)
  • @Wangcy-rachel - 王春阳
  • @zoe3251 - 舒晨阳

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(完)

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