生信爱好者周刊（第 158期）：AI离彻底改变人类社会的能力只有10年¶

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封面图¶

本周话题：AI离彻底改变人类社会的能力只有10年 ¶

谷歌DeepMind CEO Demis Hassabis说，将人工智能视为普通技术是错误的，人工智能将具有“划时代的意义”，很快将治愈所有疾病、解决气候和能源问题并丰富我们的生活，AGI大概需要 10 年时间，因为还需要 2 到 3 项重大创新，下一项就是基于代理的系统，能够完成你给它的特定目标或任务。

生信研究¶

1、Evo2 | NVIDIA发布预测所有物种DNA、RNA、蛋白质的形式和功能的最大AI生物模型

Arc研究所、斯坦福大学和NVIDIA联合发布了史上最大生物AI模型Evo-2。该模型基于128,000个基因组训练，涵盖从人类到细菌的多种生物，可预测DNA、RNA、蛋白质的功能，并生成染色体和小基因组。它还理解非编码基因变体，有望助力基因组设计和疾病研究。

论文链接：https://arcinstitute.org/manuscripts/Evo2

2、Science | 赢得诺奖不是终点！David Baker再获里程碑突破——AI首次从头设计出蛋白酶

该研究利用 AI 从头设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶，这也是首次从头设计一种新的酶，其能够加快一个四步化学反应，该反应对于许多生物和工业过程至关重要，其中包括塑料降解和回收。

文章链接：https://www.science.org/doi/10.1126/science.adu2454

3、Cancer Cell | 三阴性乳腺癌化疗与免疫治疗的协同机制

研究团队系统整合了前期关于紫杉醇联合PD-L1抗体治疗的单细胞测序数据，并结合最新生成的白蛋白结合型紫杉醇（Nab-PTX）与PD-L1抗体联合的单细胞测序数据，对TNBC患者接受紫杉醇、白蛋白紫杉醇及其与PD-L1抗体阿替丽珠单抗联合治疗后的肿瘤免疫微环境进行了系统性分析，揭示了不同化疗药物在拮抗或协同免疫治疗中的独特作用机制，并提出了肥大细胞作为潜在治疗靶点的新观点，为优化TNBC的精准治疗策略提供了全新的理论依据。

论文链接：https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(25)00025-X

博文资讯¶

4、跟着Nature学作图——风车图

该推文复现了Nature中出现的风车图，包含所有代码和数据文件。

5、万人围观，用DeepSeek搭建个人知识库，真香！（附完整教程）

本文介绍如何使用DeepSeek搭建个人知识库，方便集中管理和快速检索文档、笔记等资料。教程包括：下载安装Cherry Studio、注册登录“硅基流动”平台、配置API秘钥、添加对话和嵌入模型、创建知识库、上传文件并生成向量，以及通过智能助手引用知识库回复问题。网页版适合个人数据不涉及泄露风险的用户，本地部署则需较高硬件配置。

6、一个完整的生信研究流程

推文中详细讲解了如何设计一个生物信息学研究，包括从科研问题到数据分析的各个步骤。

工具¶

7、shiny 版交互式大语言模型 shiny.ollama

本文介绍了 shiny.ollama，一个基于 R Shiny 和 Ollama 的交互式大语言模型工具，支持本地部署，具备完全离线、隐私保护、模型选择、消息输入、聊天记录保存等功能。用户需先安装 Ollama 和 shiny.ollama（可通过 CRAN 或 GitHub 下载）。安装完成后运行 shiny.ollama::run_app() 即可启动应用。

8、知识库AI问答助手 - 馆长